恒温摇床的振幅和转速都会影响培养基中的氧气传递效率OTR。氧气传递效率是指氧气从大气中传入到液体中的效率。OTR数值越高，氧传递效率越高。 混合效果越好，氧传递速率(OTR)就越好。当然很多科研人员也会用溶氧量这个数据来解释。一般来说，振幅大，转速快，OTR和溶氧效率都会高。转速振幅的高低对于耗氧量大的菌，受溶氧影响大的菌株影响十分明显。像做柠檬酸发酵等需氧量大时实验，转速过低会导致活菌数目大大减少的。

在《毒力菌株发酵时间的优化实验》中对恒温摇床转速设置4个梯度来研宄对菌株B.HLJ-37的影响，分别在转速为0、100、200、250r/min时，进行单因素对发酵的影响试验。试验结果显示：细胞摇床转速对发酵产生的活芽孢数以及活菌数也有着十分显著的影响。发酵结束后，测定细胞摇床转速为200r/min时，菌液中活芽孢数已经达到9.;05X108CFU/mL，而细胞摇床转速为0、100、250r/min的菌液中活芽孢数仅为9.31X107、3.37X108、6.32Xl08CTU/mL。测定细胞摇床转速为200r/min时，菌液中活菌数已经达到3.01X109CFU/mL，而摇床转速为0、100、250r/min的菌液中活菌数仅为1.63X108、2.33X109、2.17X109CFU/mL。所以，可以得出摇床转影响菌体生长、导致芽孢数和晶体蛋白产量下降，致使菌株毒力降低。